PESQUISA VETERINÁRIA BRASILEIRA

Abstract in English:

ABSTRACT.- Fonteque G.V., Battilana J., Paludo E. & Lima-Rosa C.A.V. 2014. Genetic polymorphism of fifteen microsatellite loci in Brazilian (blue-egg Caipira) chickens. Pesquisa Veterinária Brasileira 34(1):98-102. Departamento de Medicina Veterinária, Centro de Ciências Agroveterinárias, Universidade do Estado de Santa Catarina, Av. Luiz de Camões 2090, Lages, SC 88520-000, Brazil. E-mail: andrelimarosa@cav.udesc.br The purpose of this study was to investigate the genetic polymorphism of fifteen microsatellites loci in Brazilian (blue-egg Caipira) chickens. Samples were collected from 100 blue eggs of Caipira chickens from rural properties in the city of Dois Lajeados, RS. After DNA extraction, the fragments related to molecular markers LEI0248, LEI0221, LEI0214, LEI0192, LEI0217, LEI0254, LEI0194, LEI0212, MCW0371, ADL0278, LEI0234, MCW0183, MCW0216, MCW0330 and MCW0081 were obtained by polymerase chain reaction (PCR). The statistical analysis were carried out with the softwares ARLEQUIN 3.5 version and CERVUS 3.0.3 version. The allelic and genotypic frequencies, deviations from Hardy-Weinberg equilibrium, estimates of observed (HO) and expected (HE) heterozygosity and polymorphic information content (PIC) were obtained for each marker locus. A total of 186 alleles from 15 loci were obtained, with sizes ranging of 83 to 490 base pairs. The medium number of alleles was 12.4, the HE was 0.76±0.14 and HO was 0.49±0.21 and PIC was 0.706. The first conclusion is that the microsatellites used are polymorphic and can be used to genetic studies in chickens. The second is that the “Caipira” chicken (blue eggs) population investigated has a great genic variability, which makes than an important source of genetic resources for future animal breeding programs.

• Genetic polymorphism polimorfismo genétic

Abstract in Portuguese:

RESUMO.- Fonteque G.V., Battilana J., Paludo E. & Lima-Rosa C.A.V. 2014. Genetic polymorphism of fifteen microsatellite loci in Brazilian (blue-egg Caipira) chickens. [Polimorfismo genético de quinze loci de microssatélites em galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis.] Pesquisa Veterinária Brasileira 34(1):98-102. Departamento de Medicina Veterinária, Centro de Ciências Agroveterinárias, Universidade do Estado de Santa Catarina, Av. Luiz de Camões 2090, Lages, SC 88520-000, Brazil. E-mail: andrelimarosa@cav.udesc.br O objetivo deste trabalho foi investigar a variabilidade genética de quinze loci de microssatélites em galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis. Foram coletadas amostras de sangue de 100 galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis provenientes de propriedades da região rural do município de Dois Lajeados, RS. Após extração do DNA foram utilizados marcadores para quinze loci de microssatélites: LEI0248, LEI0221, LEI0214, LEI0192, LEI0217, LEI0254, LEI0194, LEI0212, MCW0371, ADL0278, LEI0234, MCW0183, MCW0216, MCW0330 e MCW0081 que foram amplificados por meio da técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR). A análise estatística foi conduzida utilizando o programa ARLEQUIN ver 3.5 e CERVUS ver 3.0.3. Foram determinadas às frequências alélicas, genotípicas e estimativas de heterozigosidade esperada (HE) e observada (HO), desvios do Equilíbrio de Hardy-Weinberg e conteúdo de informação polimórfica (PIC) para cada locus de microssatélite. Os resultados demonstraram um total de 186 alelos (somando os alelos dos 15 loci), com os fragmentos variando entre 83 e 490 pares de base, com número médio de alelos de 12,4, HE de 0,76±0,14 e HO de 0,49±0,21 e PIC de 0,706. Conclui-se que os microssatélites utilizados são polimórficos e que podem, portanto, serem utilizados para investigações genéticas em galinhas. A população de galinhas caipiras de ovos azuis analisada apresenta grande variabilidade gênica, o que as torna uma importante fonte de recursos genéticos, e que poderão, assim, serem utilizadas em futuros programas de melhoramento genético animal.

Abstract in English:

ABSTRACT.- Madruga C.R., Leal C.R.B., Ferreira A.M.T., Araújo F.R., Bonato A.L.V., Kessler R.H., Schenk M.A.M. & Soares C.O. 2002. Genetic and antigenic analysis of Babesia bigemina isolates from five geographical regions of Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira 22(4):153- 160. [Análise genética e antigênica de isolados de Babesia bigemina das cinco regiões fisiográficas do Brasil.] Embrapa Gado de Corte, Rodovia BR 262 Km 4, Cx. Postal 154, Campo Grande, MS 79002-970, Brazil. A molecular epidemiological study was performed with Babesia bigemina isolates from five geographical regions of Brazil. The genetic analysis was done with random amplification of polymorphic DNA (RAPD), repetitive extragenic palindromic elements-polymerase chain reaction (REP-PCR) and enterobacterial repetitive intergenic consensus sequences-polymerase chain reaction (ERIC-PCR) that showed genetic polymorphism between these isolates and generated fingerprinting. In RAPD, IL0872 and IL0876 primers were able to detect at least one fingerprinting for each B. bigemina isolate. The amplification of B. bigemina DNA fragments by REP-PCR and ERIC-PCR gave evidence for the presence in this haemoprotozoan of the sequences described previously in microorganisms of the bacterial kingdom. For the first time it was demonstrated that both techniques can be used for genetic analysis of a protozoan parasite, although the ERIC-PCR was more discriminatory than REP-PCR. Toe dendogram with similarity coeficiente among isolates showed two clusters and one subcluster. The Northeastern and Mid-Westem isolates showed the greatest genetic diversity, while the Southeastem and Southem isolates were the closest. Toe antigenic analysis was done through indirect fluorescent antibodytechnique and Westem blotting using a panei of monoclonal antibodies directed against epitopes on the merozoite membrane surface, rhoptries and membrane of infected erythrocytes. As expected, the merozoite variable surface antigens, major surface antigen (MSA)-1 and MSA-2 showed antigenic diversity. However, B cell epitopes on rhoptries and infected erythrocytes were conserved among all isolates studied. In this study it was possible to identify variable and conserved antigens, which had already been described as potential immunogens. Considering that an attenuated Babesia clone used as immunogen selected populations capable of evading the immunity induced by this vaccine, it is necessary to evaluate more deeply the cross-protection conferred by genetically more distant Brazilian B. bigemina isolates and make an evaluation of the polymorphism degree of variable antigens such as MSA-1 and MSA-2.

• Babesia bigemina Brazilian isolates genetic polymorphism antigenic polymorphism isolados brasileiros polimorfismo genético polimorfismo antigênico.

Abstract in Portuguese:

RESUMO.- Madruga C.R., Leal C.R.B., Ferreira A.M.T., Araújo F.R., Bonato A.L.V., Kessler R.H., Schenk M.A.M. & Soares C.O. 2002. Genetic and antigenic analysis of Babesia bigemina isolates from five geographical regions of Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira 22(4):153- 160. [Análise genética e antigênica de isolados de Babesia bigemina das cinco regiões fisiográficas do Brasil.] Embrapa Gado de Corte, Rodovia BR 262 Km 4, Cx. Postal 154, Campo Grande, MS 79002-970, Brazil. Um estudo de epidemiologia molecular foi executado com isolados de Babesia bigemina das cinco regiões fisiográficas do Brasil. A análise genética foi feita com amplificação aleatória de DNA polimórfico (RAPD), reação da polimerase em cadeia com seqüências de elementos extragênicos repetitivos palindrômicos (REP-PCR) e reação da polimerase em cadeia com seqüências repetitivas enterobacterianas intergênicas de consenso (ERIC-PCR) que apresentaram polimorfismo genético entre os isolados e geraram marcadores. No RAPD com os oligonucleotídeos iniciadores IL0872 e IL0876, foi possível detectar pelo menos um marcador por isolado de B. bigemina. A amplificação de fragmentos de DNA de B. bigemina por REPPCR e ERIC-PCR demonstrou a presença dessas seqüências, descritas anteriormente somente em microrganismos bacterianos, nesse hemoprotozoârio, e, pela primeira vez, foi verificado que podem ser utilizadas para análise genética de um protozoário. O ERIC-PCR foi mais discriminatório que o REP-PCR. O dendograma formado com o coeficiente de similaridade entre os isolados evidenciou dois agrupamentos e um subgrupo. Os isolados do Nordeste e Centro-Oeste demonstraram maior diversidade genética, enquanto que os isolados do Sudeste e Sul foram os mais próximos. A análise antigênica foi executada por meio de imunofluorescência indireta e Western blotting usando um painel de anticorpos monoclonais direcionados a epitopos B na membrana dos merozoítos, roptries e membrana de eritrócitos infectados. Os antígenos variáveis da superfície dos merozoítos, antígeno principal da superfície do merozoíto (APSM)-1 e APSM-2 apresentaram diversidade antigênica. Entretanto, os epítopos de células B nas roptries e nos eritrócitos infectados foram conservados em todos os isolados. Nesse estudo foi possível identificar antígenos variáveis e conservados que anteriormente haviam sido descritos como potenciais imunógenos. Considerando que um clone atenuado de Babesia utilizado para imunização selecionou populações capazes de evadir a resposta imune à vacina, torna-se necessário avaliar mais detalhadamente a imunidade cruzada existente entre os isolados brasileiros mais distantes geneticamente e realizar uma avaliação do grau de polimorfismo dos antígenos variáveis APSM-1 e APSM-2.